Województwo Lubuskie, na mocy ustawy o publicznym transporcie zbiorowym, jest organizatorem połączeń kolejowych o charakterze regionalnym. Rocznie na ich dofinansowanie przeznacza się około 55 mln zł.
Pociągi uruchamiane są na liniach komunikacyjnych:
- Kostrzyn - Gorzów Wlkp. - Krzyż - Poznań Gł.
- Berlin Ostkreuz - Kostrzyn - Gorzów Wlkp.
- Zielona Góra Gł. - Zbąszynek - Gorzów Wlkp.
- Nowa Sól - Zielona Góra Gł. - Zbąszynek - Poznań Gł.
- Zielona Góra Gł. - Głogów - Wrocław Gł.
- Zielona Góra Gł. - Rzepin - Kostrzyn - Szczecin Gł. - Świnoujście
- Zielona Góra Gł. - Rzepin - Frankfurt (Oder)
- Rzepin - Zbąszynek - Poznań Gł.
- Zielona Góra Gł. - Żary/Żagań - Węgliniec - Zgorzelec - Görlitz
- Forst(Lausitz) - Żary - Żagań - Legnica - Wrocław Gł.
- Żagań - Żary - Forst (Lausitz)
- Poznań Gł. - Krzyż - Dobiegniew - Szczecin Gł. - Świnoujście
- Zielona Góra Gł. - Głogów - Wschowa - Leszno
Organizacja połączeń kolejowych odbywa się na podstawie przyjętego przez Sejmik Województwa Lubuskiego Planu zrównoważonego rozwoju publicznego transportu zbiorowego na sieci komunikacyjnej w wojewódzkich przewozach pasażeskich.
Obecnie operatorem publicznego transportu zbiorowego na terenie naszego województwa jest spółka POLREGIO oraz Koleje Dolnośląskie na linii Forst(Lausitz) - Żary/Żagań - Legnica - Wrocław Gł.
Województwo Lubuskie jest również właścicielem taboru kolejowego, na zakup którego przeznaczono do tej pory łącznie 184,8 mln zł. W jego skład wchodzą następujące pojazdy:
- spalinowe, jednoczłonowe:
SA105 - 4 szt. - spalinowe, dwuczłonowe:
SA108 - 1 szt.
SA133 - 4 szt.
SA134 - 2 szt.
SA137 - 1 szt.
SA139 - 4 szt.
SA139 z niemiecką homologacją - 2 szt. - elektryczne, czteroczłonowe:
ED78 - 3 szt.