Na tym samym posiedzeniu elektorów wybrano także prorektorów, których kandydatury zgłasza rektor-elekt. W kadencji 2016/2020 ponownie swoje funkcje obejmą:
Prof. dr hab. inż. Magdalena Graczyk – prorektor ds. jakości kształcenia (104 głosy)
Prof. dr hab. Wojciech Strzyżewski – prorektor ds. studenckich (110 głosów) – w przypadku prorektora ds. studenckich potrzebna jest akceptacja kandydata przez studentów - elektorów
Dr hab. inż. Andrzej Pieczyński, prof. UZ – prorektor ds. rozwoju (115 głosów)
Ponieważ dotychczasowy prorektor ds. nauki i współpracy z zagranicą – prof. Zdzisław Wołk ze względów osobistych zrezygnował z kandydowania na kolejną kadencję – prorektorem został prof. dr hab. Giorgi Melikidze (111 głosów), dotychczasowy dziekan Wydziału Fizyki i Astronomii.
Do 25 kwietnia na 12 wydziałach Uniwersytetu muszą zostać wybrani dziekani i prodziekani, natomiast do 9 maja musi nastąpić wybór członków Senatu. Nowe władze obejmą swoje funkcje 1 września br.
