Województwo Lubuskie, na mocy ustawy o publicznym transporcie zbiorowym, jest organizatorem połączeń kolejowych o charakterze regionalnym.
Pociągi uruchamiane są na liniach komunikacyjnych:
- Kostrzyn - Gorzów Wlkp. - Krzyż - Poznań Gł.
- Zielona Góra Gł. - Zbąszynek - Gorzów Wlkp.
- Zielona Góra Gł. - Zbąszynek - Poznań Gł.
- Zielona Góra Gł. - Nowa Sól - Głogów
- Zielona Góra Gł. - Rzepin - Kostrzyn - Szczecin Gł.
- Zielona Góra Gł. - Rzepin - Frankfurt (Oder)
- Rzepin - Zbąszynek
- Zielona Góra Gł. - Żary/Żagań/Małomice - Węgliniec - Zgorzelec-Görlitz/Jelenia Góra
- Cottbus Hbf- Forst(Lausitz) - Tuplice - Żary - Żagań
- Poznań Gł. - Krzyż - Dobiegniew - Szczecin Gł. - Świnoujście
- Zielona Góra Gł. - Głogów - Wschowa - Leszno
- Zielona Góra Gł. - Gubin - Guben
oraz na liniach powierzonych do organizacji dla Województwa Dolnośląskiego:
- Forst(Lausitz) - Tuplice - Żary - Żagań - Legnica - Wrocław Gł.
- Zielona Góra Gł. - Głogów - Wołów/Legnica - Wrocław Gł.
a także sezonowo na liniach:
- Zielona Góra Gł. - Zbąszynek - Toporów - Łagów
- Gorzów Wlkp. - Międzyrzecz - Pszczew - Wierzbno
- Zielona Góra Gł. - Zbąszynek - Poznań Gł. - Kołobrzeg
- Zielona Góra Gł. - Rzepin - Kostrzyn - Szczecin Dąbie - Świnoujście
Organizacja połączeń kolejowych odbywa się na podstawie przyjętego przez Sejmik Województwa Lubuskiego Planu zrównoważonego rozwoju publicznego transportu zbiorowego na sieci komunikacyjnej w wojewódzkich przewozach pasażeskich.
Obecnie operatorem publicznego transportu zbiorowego na terenie naszego województwa jest spółka POLREGIO oraz Koleje Dolnośląskie na linii Forst(Lausitz) - Żary - Żagań - Legnica - Wrocław Gł. oraz Zielona Góra Gł. - Głogów - Wrocław Gł.
Województwo Lubuskie jest również właścicielem taboru kolejowego. W jego skład wchodzą następujące pojazdy:
- spalinowe, jednoczłonowe:
SA105 - 4 szt. - spalinowe, dwuczłonowe:
SA108 - 1 szt.
SA133 - 4 szt.
SA134 - 2 szt.
SA137 - 1 szt.
SA139 - 4 szt.
SA139 z niemiecką homologacją - 2 szt. - spalinowe, trójczłonowe:
SA95 - 2 szt. - elektryczne, czteroczłonowe:
ED78 - 3 szt. - spalinowo-elektryczne, dwuczłonowe:
227M - 1 szt. - spalinowo-elektryczne, trójczłonowe:
228M - 1 szt.